Protein–RNA interactions for Protein: P53794

SLC5A3, Sodium/myo-inositol cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A3P53794 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC5A3P53794 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC5A3P53794 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC5A3P53794 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC5A3P53794 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC5A3P53794 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC5A3P53794 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC5A3P53794 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC5A3P53794 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC5A3P53794 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC5A3P53794 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC5A3P53794 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC5A3P53794 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC5A3P53794 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC5A3P53794 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC5A3P53794 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC5A3P53794 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC5A3P53794 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC5A3P53794 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC5A3P53794 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC5A3P53794 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC5A3P53794 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC5A3P53794 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC5A3P53794 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC5A3P53794 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC5A3P53794 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC5A3P53794 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC5A3P53794 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC5A3P53794 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC5A3P53794 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC5A3P53794 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC5A3P53794 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC5A3P53794 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC5A3P53794 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC5A3P53794 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC5A3P53794 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC5A3P53794 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC5A3P53794 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC5A3P53794 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC5A3P53794 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC5A3P53794 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC5A3P53794 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC5A3P53794 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC5A3P53794 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC5A3P53794 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC5A3P53794 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC5A3P53794 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC5A3P53794 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC5A3P53794 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC5A3P53794 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC5A3P53794 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC5A3P53794 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC5A3P53794 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC5A3P53794 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC5A3P53794 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC5A3P53794 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC5A3P53794 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC5A3P53794 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC5A3P53794 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC5A3P53794 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC5A3P53794 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC5A3P53794 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC5A3P53794 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC5A3P53794 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC5A3P53794 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC5A3P53794 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC5A3P53794 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC5A3P53794 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC5A3P53794 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC5A3P53794 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC5A3P53794 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC5A3P53794 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC5A3P53794 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC5A3P53794 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC5A3P53794 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC5A3P53794 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC5A3P53794 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC5A3P53794 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC5A3P53794 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC5A3P53794 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC5A3P53794 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC5A3P53794 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC5A3P53794 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC5A3P53794 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC5A3P53794 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC5A3P53794 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC5A3P53794 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC5A3P53794 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC5A3P53794 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC5A3P53794 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC5A3P53794 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC5A3P53794 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC5A3P53794 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC5A3P53794 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC5A3P53794 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC5A3P53794 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC5A3P53794 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC5A3P53794 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC5A3P53794 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC5A3P53794 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms