Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms