Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MCAMP43121 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MCAMP43121 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MCAMP43121 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MCAMP43121 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MCAMP43121 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MCAMP43121 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MCAMP43121 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MCAMP43121 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MCAMP43121 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MCAMP43121 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MCAMP43121 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MCAMP43121 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MCAMP43121 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MCAMP43121 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MCAMP43121 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MCAMP43121 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MCAMP43121 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MCAMP43121 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MCAMP43121 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MCAMP43121 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MCAMP43121 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MCAMP43121 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MCAMP43121 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MCAMP43121 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MCAMP43121 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MCAMP43121 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
MCAMP43121 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MCAMP43121 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
MCAMP43121 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MCAMP43121 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MCAMP43121 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MCAMP43121 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MCAMP43121 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MCAMP43121 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MCAMP43121 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MCAMP43121 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MCAMP43121 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MCAMP43121 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MCAMP43121 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MCAMP43121 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MCAMP43121 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MCAMP43121 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MCAMP43121 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MCAMP43121 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MCAMP43121 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MCAMP43121 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MCAMP43121 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MCAMP43121 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCAMP43121 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCAMP43121 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCAMP43121 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCAMP43121 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCAMP43121 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCAMP43121 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
MCAMP43121 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCAMP43121 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCAMP43121 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCAMP43121 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCAMP43121 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCAMP43121 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCAMP43121 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCAMP43121 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
MCAMP43121 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
MCAMP43121 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCAMP43121 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCAMP43121 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCAMP43121 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCAMP43121 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCAMP43121 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCAMP43121 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCAMP43121 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCAMP43121 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCAMP43121 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCAMP43121 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCAMP43121 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCAMP43121 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCAMP43121 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCAMP43121 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCAMP43121 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCAMP43121 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCAMP43121 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCAMP43121 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCAMP43121 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCAMP43121 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCAMP43121 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCAMP43121 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCAMP43121 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCAMP43121 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCAMP43121 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCAMP43121 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MCAMP43121 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCAMP43121 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCAMP43121 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCAMP43121 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCAMP43121 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCAMP43121 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCAMP43121 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCAMP43121 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCAMP43121 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms