Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GGCXP38435 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GGCXP38435 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GGCXP38435 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GGCXP38435 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GGCXP38435 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GGCXP38435 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GGCXP38435 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GGCXP38435 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GGCXP38435 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GGCXP38435 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GGCXP38435 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GGCXP38435 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GGCXP38435 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GGCXP38435 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GGCXP38435 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GGCXP38435 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GGCXP38435 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GGCXP38435 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GGCXP38435 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GGCXP38435 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GGCXP38435 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GGCXP38435 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GGCXP38435 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GGCXP38435 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GGCXP38435 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GGCXP38435 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GGCXP38435 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GGCXP38435 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GGCXP38435 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GGCXP38435 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GGCXP38435 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GGCXP38435 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GGCXP38435 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GGCXP38435 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GGCXP38435 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GGCXP38435 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GGCXP38435 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GGCXP38435 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GGCXP38435 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GGCXP38435 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GGCXP38435 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GGCXP38435 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GGCXP38435 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GGCXP38435 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GGCXP38435 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GGCXP38435 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GGCXP38435 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GGCXP38435 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GGCXP38435 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GGCXP38435 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GGCXP38435 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
GGCXP38435 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GGCXP38435 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GGCXP38435 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GGCXP38435 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GGCXP38435 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GGCXP38435 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GGCXP38435 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GGCXP38435 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GGCXP38435 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GGCXP38435 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GGCXP38435 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GGCXP38435 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GGCXP38435 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GGCXP38435 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GGCXP38435 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GGCXP38435 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GGCXP38435 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GGCXP38435 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GGCXP38435 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GGCXP38435 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GGCXP38435 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GGCXP38435 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GGCXP38435 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GGCXP38435 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GGCXP38435 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GGCXP38435 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GGCXP38435 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GGCXP38435 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GGCXP38435 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GGCXP38435 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GGCXP38435 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GGCXP38435 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GGCXP38435 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GGCXP38435 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GGCXP38435 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GGCXP38435 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GGCXP38435 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GGCXP38435 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GGCXP38435 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GGCXP38435 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GGCXP38435 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GGCXP38435 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GGCXP38435 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GGCXP38435 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GGCXP38435 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GGCXP38435 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GGCXP38435 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GGCXP38435 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms