Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms