Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

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Length 558 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GPC1P35052 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GPC1P35052 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GPC1P35052 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GPC1P35052 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GPC1P35052 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GPC1P35052 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GPC1P35052 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GPC1P35052 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GPC1P35052 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
GPC1P35052 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GPC1P35052 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GPC1P35052 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GPC1P35052 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GPC1P35052 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GPC1P35052 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GPC1P35052 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GPC1P35052 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
GPC1P35052 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GPC1P35052 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GPC1P35052 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GPC1P35052 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GPC1P35052 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GPC1P35052 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GPC1P35052 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
GPC1P35052 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GPC1P35052 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GPC1P35052 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GPC1P35052 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GPC1P35052 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GPC1P35052 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GPC1P35052 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GPC1P35052 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GPC1P35052 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GPC1P35052 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GPC1P35052 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GPC1P35052 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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GPC1P35052 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GPC1P35052 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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GPC1P35052 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GPC1P35052 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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GPC1P35052 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GPC1P35052 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GPC1P35052 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GPC1P35052 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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GPC1P35052 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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GPC1P35052 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GPC1P35052 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GPC1P35052 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GPC1P35052 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GPC1P35052 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
GPC1P35052 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
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GPC1P35052 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
GPC1P35052 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.1
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GPC1P35052 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
GPC1P35052 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
GPC1P35052 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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GPC1P35052 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
GPC1P35052 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
GPC1P35052 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
GPC1P35052 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
GPC1P35052 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
GPC1P35052 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
GPC1P35052 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
GPC1P35052 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
GPC1P35052 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
GPC1P35052 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
GPC1P35052 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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