Protein–RNA interactions for Protein: P32418

SLC8A1, Sodium/calcium exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 973 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A1P32418 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC8A1P32418 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms