Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CNGA1P29973 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms