Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMBRP28336 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMBRP28336 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMBRP28336 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMBRP28336 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMBRP28336 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMBRP28336 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMBRP28336 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMBRP28336 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMBRP28336 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMBRP28336 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMBRP28336 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMBRP28336 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMBRP28336 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NMBRP28336 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMBRP28336 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMBRP28336 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMBRP28336 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMBRP28336 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMBRP28336 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMBRP28336 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NMBRP28336 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMBRP28336 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMBRP28336 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NMBRP28336 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMBRP28336 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMBRP28336 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMBRP28336 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMBRP28336 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMBRP28336 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMBRP28336 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMBRP28336 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMBRP28336 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMBRP28336 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMBRP28336 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMBRP28336 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMBRP28336 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMBRP28336 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMBRP28336 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMBRP28336 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMBRP28336 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMBRP28336 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMBRP28336 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMBRP28336 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMBRP28336 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMBRP28336 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMBRP28336 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMBRP28336 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMBRP28336 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMBRP28336 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMBRP28336 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMBRP28336 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMBRP28336 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMBRP28336 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMBRP28336 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMBRP28336 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NMBRP28336 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMBRP28336 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMBRP28336 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMBRP28336 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMBRP28336 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMBRP28336 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMBRP28336 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMBRP28336 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NMBRP28336 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMBRP28336 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMBRP28336 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NMBRP28336 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMBRP28336 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMBRP28336 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMBRP28336 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMBRP28336 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMBRP28336 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMBRP28336 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMBRP28336 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMBRP28336 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMBRP28336 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMBRP28336 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMBRP28336 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMBRP28336 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMBRP28336 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMBRP28336 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMBRP28336 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMBRP28336 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMBRP28336 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMBRP28336 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMBRP28336 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMBRP28336 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMBRP28336 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMBRP28336 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMBRP28336 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMBRP28336 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMBRP28336 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMBRP28336 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMBRP28336 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMBRP28336 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMBRP28336 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMBRP28336 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMBRP28336 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMBRP28336 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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