Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SDSP20132 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SDSP20132 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SDSP20132 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SDSP20132 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SDSP20132 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SDSP20132 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SDSP20132 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SDSP20132 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SDSP20132 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SDSP20132 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SDSP20132 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SDSP20132 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SDSP20132 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SDSP20132 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SDSP20132 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SDSP20132 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SDSP20132 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDSP20132 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDSP20132 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDSP20132 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDSP20132 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDSP20132 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDSP20132 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDSP20132 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDSP20132 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDSP20132 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDSP20132 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDSP20132 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDSP20132 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDSP20132 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDSP20132 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDSP20132 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDSP20132 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDSP20132 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDSP20132 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDSP20132 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDSP20132 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SDSP20132 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDSP20132 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDSP20132 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDSP20132 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDSP20132 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDSP20132 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDSP20132 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDSP20132 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDSP20132 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDSP20132 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDSP20132 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDSP20132 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDSP20132 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDSP20132 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDSP20132 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDSP20132 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDSP20132 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDSP20132 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDSP20132 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDSP20132 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDSP20132 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDSP20132 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDSP20132 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SDSP20132 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SDSP20132 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SDSP20132 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SDSP20132 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SDSP20132 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SDSP20132 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SDSP20132 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SDSP20132 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SDSP20132 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SDSP20132 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SDSP20132 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SDSP20132 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SDSP20132 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SDSP20132 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SDSP20132 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SDSP20132 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SDSP20132 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SDSP20132 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SDSP20132 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SDSP20132 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SDSP20132 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SDSP20132 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SDSP20132 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SDSP20132 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SDSP20132 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SDSP20132 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SDSP20132 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SDSP20132 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SDSP20132 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SDSP20132 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SDSP20132 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SDSP20132 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SDSP20132 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SDSP20132 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SDSP20132 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SDSP20132 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SDSP20132 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SDSP20132 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SDSP20132 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms