Protein–RNA interactions for Protein: P19878

NCF2, Neutrophil cytosol factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF2P19878 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NCF2P19878 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NCF2P19878 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NCF2P19878 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NCF2P19878 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NCF2P19878 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NCF2P19878 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NCF2P19878 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NCF2P19878 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NCF2P19878 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NCF2P19878 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NCF2P19878 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NCF2P19878 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NCF2P19878 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NCF2P19878 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NCF2P19878 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NCF2P19878 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NCF2P19878 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NCF2P19878 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NCF2P19878 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NCF2P19878 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NCF2P19878 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NCF2P19878 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NCF2P19878 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NCF2P19878 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NCF2P19878 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NCF2P19878 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NCF2P19878 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NCF2P19878 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NCF2P19878 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NCF2P19878 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NCF2P19878 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NCF2P19878 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NCF2P19878 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NCF2P19878 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NCF2P19878 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NCF2P19878 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NCF2P19878 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NCF2P19878 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NCF2P19878 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NCF2P19878 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NCF2P19878 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NCF2P19878 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NCF2P19878 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NCF2P19878 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NCF2P19878 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NCF2P19878 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NCF2P19878 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NCF2P19878 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NCF2P19878 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NCF2P19878 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NCF2P19878 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NCF2P19878 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NCF2P19878 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NCF2P19878 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NCF2P19878 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NCF2P19878 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NCF2P19878 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NCF2P19878 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NCF2P19878 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NCF2P19878 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NCF2P19878 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NCF2P19878 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NCF2P19878 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NCF2P19878 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NCF2P19878 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NCF2P19878 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NCF2P19878 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NCF2P19878 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NCF2P19878 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NCF2P19878 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NCF2P19878 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NCF2P19878 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NCF2P19878 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NCF2P19878 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NCF2P19878 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NCF2P19878 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NCF2P19878 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NCF2P19878 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NCF2P19878 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NCF2P19878 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NCF2P19878 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NCF2P19878 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
NCF2P19878 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NCF2P19878 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NCF2P19878 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NCF2P19878 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NCF2P19878 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NCF2P19878 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NCF2P19878 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NCF2P19878 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NCF2P19878 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NCF2P19878 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NCF2P19878 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NCF2P19878 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NCF2P19878 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NCF2P19878 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NCF2P19878 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NCF2P19878 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NCF2P19878 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms