Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATF3P18847 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATF3P18847 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATF3P18847 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATF3P18847 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATF3P18847 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATF3P18847 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATF3P18847 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATF3P18847 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATF3P18847 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATF3P18847 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATF3P18847 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ATF3P18847 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATF3P18847 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATF3P18847 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATF3P18847 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATF3P18847 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ATF3P18847 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATF3P18847 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ATF3P18847 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATF3P18847 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATF3P18847 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ATF3P18847 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ATF3P18847 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATF3P18847 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATF3P18847 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATF3P18847 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATF3P18847 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATF3P18847 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATF3P18847 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATF3P18847 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATF3P18847 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATF3P18847 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATF3P18847 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATF3P18847 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATF3P18847 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ATF3P18847 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATF3P18847 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATF3P18847 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATF3P18847 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATF3P18847 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATF3P18847 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATF3P18847 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATF3P18847 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATF3P18847 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATF3P18847 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATF3P18847 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATF3P18847 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATF3P18847 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATF3P18847 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATF3P18847 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATF3P18847 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATF3P18847 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATF3P18847 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATF3P18847 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATF3P18847 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATF3P18847 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ATF3P18847 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATF3P18847 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATF3P18847 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ATF3P18847 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ATF3P18847 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATF3P18847 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATF3P18847 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ATF3P18847 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATF3P18847 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATF3P18847 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATF3P18847 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATF3P18847 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATF3P18847 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATF3P18847 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATF3P18847 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATF3P18847 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATF3P18847 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATF3P18847 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATF3P18847 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATF3P18847 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATF3P18847 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATF3P18847 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATF3P18847 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATF3P18847 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATF3P18847 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATF3P18847 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATF3P18847 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATF3P18847 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATF3P18847 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ATF3P18847 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ATF3P18847 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATF3P18847 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATF3P18847 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATF3P18847 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATF3P18847 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATF3P18847 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATF3P18847 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATF3P18847 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATF3P18847 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATF3P18847 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATF3P18847 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATF3P18847 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATF3P18847 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms