Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAV1P15498 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAV1P15498 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAV1P15498 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAV1P15498 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAV1P15498 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAV1P15498 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAV1P15498 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAV1P15498 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAV1P15498 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAV1P15498 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAV1P15498 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAV1P15498 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAV1P15498 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAV1P15498 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAV1P15498 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAV1P15498 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAV1P15498 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
VAV1P15498 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAV1P15498 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
VAV1P15498 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
VAV1P15498 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
VAV1P15498 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAV1P15498 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAV1P15498 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAV1P15498 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAV1P15498 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
VAV1P15498 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAV1P15498 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAV1P15498 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAV1P15498 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAV1P15498 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAV1P15498 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAV1P15498 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAV1P15498 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAV1P15498 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAV1P15498 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAV1P15498 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAV1P15498 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAV1P15498 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAV1P15498 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAV1P15498 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAV1P15498 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAV1P15498 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAV1P15498 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAV1P15498 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAV1P15498 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAV1P15498 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAV1P15498 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAV1P15498 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAV1P15498 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAV1P15498 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAV1P15498 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAV1P15498 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAV1P15498 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAV1P15498 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAV1P15498 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAV1P15498 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAV1P15498 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAV1P15498 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAV1P15498 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAV1P15498 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAV1P15498 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAV1P15498 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAV1P15498 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
VAV1P15498 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAV1P15498 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAV1P15498 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
VAV1P15498 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
VAV1P15498 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
VAV1P15498 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAV1P15498 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAV1P15498 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAV1P15498 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAV1P15498 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAV1P15498 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAV1P15498 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
VAV1P15498 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAV1P15498 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAV1P15498 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAV1P15498 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAV1P15498 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAV1P15498 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAV1P15498 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAV1P15498 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAV1P15498 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAV1P15498 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAV1P15498 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAV1P15498 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAV1P15498 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAV1P15498 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAV1P15498 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAV1P15498 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAV1P15498 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAV1P15498 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAV1P15498 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAV1P15498 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAV1P15498 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAV1P15498 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAV1P15498 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms