Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
TNNT1P13805 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TNNT1P13805 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
TNNT1P13805 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TNNT1P13805 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNNT1P13805 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNNT1P13805 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNNT1P13805 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNNT1P13805 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNNT1P13805 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNNT1P13805 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNNT1P13805 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNNT1P13805 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNNT1P13805 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNNT1P13805 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNNT1P13805 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNNT1P13805 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNNT1P13805 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNNT1P13805 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNNT1P13805 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNNT1P13805 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNNT1P13805 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNNT1P13805 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNNT1P13805 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNNT1P13805 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNNT1P13805 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNNT1P13805 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNNT1P13805 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNNT1P13805 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TNNT1P13805 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNNT1P13805 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNNT1P13805 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TNNT1P13805 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TNNT1P13805 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNNT1P13805 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNNT1P13805 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNNT1P13805 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNNT1P13805 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNNT1P13805 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNNT1P13805 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNNT1P13805 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNNT1P13805 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNNT1P13805 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNNT1P13805 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNNT1P13805 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNNT1P13805 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNNT1P13805 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNNT1P13805 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNNT1P13805 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNNT1P13805 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNNT1P13805 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNNT1P13805 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNNT1P13805 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNNT1P13805 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNNT1P13805 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNNT1P13805 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNNT1P13805 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNNT1P13805 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNNT1P13805 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TNNT1P13805 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNNT1P13805 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNNT1P13805 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNNT1P13805 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNNT1P13805 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNNT1P13805 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNNT1P13805 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNNT1P13805 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNNT1P13805 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNNT1P13805 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNNT1P13805 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNNT1P13805 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNNT1P13805 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNNT1P13805 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNNT1P13805 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TNNT1P13805 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNNT1P13805 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TNNT1P13805 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TNNT1P13805 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms