Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEFLP07196 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEFLP07196 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEFLP07196 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEFLP07196 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEFLP07196 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEFLP07196 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEFLP07196 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEFLP07196 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEFLP07196 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEFLP07196 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEFLP07196 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEFLP07196 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEFLP07196 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEFLP07196 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEFLP07196 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEFLP07196 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEFLP07196 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEFLP07196 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEFLP07196 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NEFLP07196 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEFLP07196 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEFLP07196 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEFLP07196 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEFLP07196 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEFLP07196 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEFLP07196 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEFLP07196 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NEFLP07196 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEFLP07196 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEFLP07196 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEFLP07196 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEFLP07196 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEFLP07196 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEFLP07196 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEFLP07196 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEFLP07196 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEFLP07196 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEFLP07196 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEFLP07196 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEFLP07196 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEFLP07196 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEFLP07196 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEFLP07196 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEFLP07196 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEFLP07196 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEFLP07196 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEFLP07196 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEFLP07196 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEFLP07196 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEFLP07196 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEFLP07196 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEFLP07196 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEFLP07196 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NEFLP07196 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEFLP07196 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NEFLP07196 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEFLP07196 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEFLP07196 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEFLP07196 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEFLP07196 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEFLP07196 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEFLP07196 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEFLP07196 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEFLP07196 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEFLP07196 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEFLP07196 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEFLP07196 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEFLP07196 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEFLP07196 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEFLP07196 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEFLP07196 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEFLP07196 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NEFLP07196 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEFLP07196 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEFLP07196 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEFLP07196 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEFLP07196 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEFLP07196 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEFLP07196 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEFLP07196 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEFLP07196 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEFLP07196 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEFLP07196 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEFLP07196 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEFLP07196 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEFLP07196 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEFLP07196 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NEFLP07196 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NEFLP07196 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NEFLP07196 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NEFLP07196 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NEFLP07196 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NEFLP07196 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NEFLP07196 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NEFLP07196 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NEFLP07196 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NEFLP07196 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NEFLP07196 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NEFLP07196 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms