Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPLO60437 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPLO60437 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPLO60437 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPLO60437 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPLO60437 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPLO60437 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPLO60437 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPLO60437 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPLO60437 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPLO60437 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPLO60437 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPLO60437 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PPLO60437 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PPLO60437 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPLO60437 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPLO60437 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPLO60437 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPLO60437 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPLO60437 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPLO60437 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPLO60437 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPLO60437 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPLO60437 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPLO60437 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPLO60437 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PPLO60437 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PPLO60437 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PPLO60437 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PPLO60437 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PPLO60437 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PPLO60437 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PPLO60437 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PPLO60437 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PPLO60437 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PPLO60437 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PPLO60437 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PPLO60437 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PPLO60437 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PPLO60437 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PPLO60437 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PPLO60437 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PPLO60437 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPLO60437 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPLO60437 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPLO60437 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPLO60437 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPLO60437 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPLO60437 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPLO60437 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPLO60437 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPLO60437 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PPLO60437 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PPLO60437 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPLO60437 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPLO60437 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPLO60437 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPLO60437 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPLO60437 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPLO60437 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPLO60437 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPLO60437 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPLO60437 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPLO60437 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPLO60437 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPLO60437 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPLO60437 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPLO60437 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPLO60437 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPLO60437 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPLO60437 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPLO60437 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPLO60437 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPLO60437 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPLO60437 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPLO60437 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PPLO60437 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PPLO60437 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PPLO60437 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PPLO60437 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PPLO60437 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PPLO60437 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PPLO60437 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PPLO60437 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PPLO60437 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PPLO60437 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PPLO60437 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PPLO60437 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PPLO60437 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PPLO60437 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PPLO60437 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PPLO60437 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PPLO60437 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PPLO60437 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PPLO60437 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PPLO60437 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PPLO60437 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PPLO60437 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PPLO60437 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PPLO60437 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms