Protein–RNA interactions for Protein: O43852

CALU, Calumenin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALUO43852 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CALUO43852 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CALUO43852 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CALUO43852 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CALUO43852 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CALUO43852 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CALUO43852 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CALUO43852 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CALUO43852 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CALUO43852 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CALUO43852 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CALUO43852 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CALUO43852 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CALUO43852 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CALUO43852 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CALUO43852 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CALUO43852 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CALUO43852 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CALUO43852 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CALUO43852 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CALUO43852 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CALUO43852 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CALUO43852 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CALUO43852 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CALUO43852 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CALUO43852 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CALUO43852 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CALUO43852 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CALUO43852 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CALUO43852 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CALUO43852 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CALUO43852 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CALUO43852 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CALUO43852 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CALUO43852 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CALUO43852 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CALUO43852 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CALUO43852 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CALUO43852 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CALUO43852 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CALUO43852 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CALUO43852 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CALUO43852 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CALUO43852 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CALUO43852 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CALUO43852 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CALUO43852 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CALUO43852 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CALUO43852 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CALUO43852 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALUO43852 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALUO43852 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CALUO43852 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALUO43852 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALUO43852 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALUO43852 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALUO43852 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALUO43852 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALUO43852 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALUO43852 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALUO43852 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALUO43852 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALUO43852 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALUO43852 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALUO43852 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALUO43852 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CALUO43852 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALUO43852 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CALUO43852 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALUO43852 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALUO43852 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALUO43852 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALUO43852 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALUO43852 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALUO43852 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALUO43852 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALUO43852 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALUO43852 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALUO43852 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALUO43852 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALUO43852 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALUO43852 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CALUO43852 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALUO43852 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALUO43852 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CALUO43852 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALUO43852 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALUO43852 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALUO43852 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALUO43852 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALUO43852 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALUO43852 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALUO43852 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALUO43852 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALUO43852 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALUO43852 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALUO43852 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALUO43852 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALUO43852 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALUO43852 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms