Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms