Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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