Protein–RNA interactions for Protein: B5MD39

GGTLC3, Putative glutathione hydrolase light chain 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTLC3B5MD39 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms