Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms