Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms