Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRAMEF22A3QJZ6 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRAMEF22A3QJZ6 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRAMEF22A3QJZ6 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRAMEF22A3QJZ6 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRAMEF22A3QJZ6 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRAMEF22A3QJZ6 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRAMEF22A3QJZ6 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRAMEF22A3QJZ6 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRAMEF22A3QJZ6 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRAMEF22A3QJZ6 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRAMEF22A3QJZ6 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRAMEF22A3QJZ6 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRAMEF22A3QJZ6 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRAMEF22A3QJZ6 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRAMEF22A3QJZ6 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRAMEF22A3QJZ6 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRAMEF22A3QJZ6 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRAMEF22A3QJZ6 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRAMEF22A3QJZ6 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRAMEF22A3QJZ6 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRAMEF22A3QJZ6 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PRAMEF22A3QJZ6 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PRAMEF22A3QJZ6 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PRAMEF22A3QJZ6 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRAMEF22A3QJZ6 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRAMEF22A3QJZ6 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRAMEF22A3QJZ6 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PRAMEF22A3QJZ6 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRAMEF22A3QJZ6 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PRAMEF22A3QJZ6 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PRAMEF22A3QJZ6 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PRAMEF22A3QJZ6 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRAMEF22A3QJZ6 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRAMEF22A3QJZ6 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRAMEF22A3QJZ6 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRAMEF22A3QJZ6 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRAMEF22A3QJZ6 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRAMEF22A3QJZ6 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRAMEF22A3QJZ6 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRAMEF22A3QJZ6 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRAMEF22A3QJZ6 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRAMEF22A3QJZ6 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PRAMEF22A3QJZ6 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRAMEF22A3QJZ6 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRAMEF22A3QJZ6 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRAMEF22A3QJZ6 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRAMEF22A3QJZ6 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRAMEF22A3QJZ6 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRAMEF22A3QJZ6 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRAMEF22A3QJZ6 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRAMEF22A3QJZ6 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRAMEF22A3QJZ6 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRAMEF22A3QJZ6 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRAMEF22A3QJZ6 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRAMEF22A3QJZ6 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRAMEF22A3QJZ6 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRAMEF22A3QJZ6 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRAMEF22A3QJZ6 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PRAMEF22A3QJZ6 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PRAMEF22A3QJZ6 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRAMEF22A3QJZ6 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PRAMEF22A3QJZ6 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PRAMEF22A3QJZ6 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRAMEF22A3QJZ6 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRAMEF22A3QJZ6 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRAMEF22A3QJZ6 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRAMEF22A3QJZ6 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRAMEF22A3QJZ6 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRAMEF22A3QJZ6 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRAMEF22A3QJZ6 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRAMEF22A3QJZ6 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRAMEF22A3QJZ6 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRAMEF22A3QJZ6 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRAMEF22A3QJZ6 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRAMEF22A3QJZ6 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRAMEF22A3QJZ6 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRAMEF22A3QJZ6 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRAMEF22A3QJZ6 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRAMEF22A3QJZ6 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRAMEF22A3QJZ6 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRAMEF22A3QJZ6 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRAMEF22A3QJZ6 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRAMEF22A3QJZ6 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRAMEF22A3QJZ6 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRAMEF22A3QJZ6 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRAMEF22A3QJZ6 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRAMEF22A3QJZ6 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRAMEF22A3QJZ6 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRAMEF22A3QJZ6 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRAMEF22A3QJZ6 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRAMEF22A3QJZ6 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRAMEF22A3QJZ6 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRAMEF22A3QJZ6 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRAMEF22A3QJZ6 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRAMEF22A3QJZ6 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRAMEF22A3QJZ6 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRAMEF22A3QJZ6 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRAMEF22A3QJZ6 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms