Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms