Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UTP11Q9Y3A2 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms