Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL01

DSE, Dermatan-sulfate epimerase, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSEQ9UL01 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.1 ms