Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,791 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN11AQ9UI33 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN11AQ9UI33 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN11AQ9UI33 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN11AQ9UI33 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN11AQ9UI33 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN11AQ9UI33 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN11AQ9UI33 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN11AQ9UI33 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN11AQ9UI33 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN11AQ9UI33 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN11AQ9UI33 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN11AQ9UI33 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN11AQ9UI33 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN11AQ9UI33 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN11AQ9UI33 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN11AQ9UI33 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN11AQ9UI33 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN11AQ9UI33 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN11AQ9UI33 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN11AQ9UI33 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN11AQ9UI33 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN11AQ9UI33 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN11AQ9UI33 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN11AQ9UI33 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN11AQ9UI33 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN11AQ9UI33 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN11AQ9UI33 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN11AQ9UI33 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN11AQ9UI33 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN11AQ9UI33 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN11AQ9UI33 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN11AQ9UI33 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN11AQ9UI33 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN11AQ9UI33 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN11AQ9UI33 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN11AQ9UI33 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN11AQ9UI33 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN11AQ9UI33 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN11AQ9UI33 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN11AQ9UI33 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN11AQ9UI33 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN11AQ9UI33 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN11AQ9UI33 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN11AQ9UI33 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN11AQ9UI33 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN11AQ9UI33 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN11AQ9UI33 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN11AQ9UI33 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN11AQ9UI33 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN11AQ9UI33 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN11AQ9UI33 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN11AQ9UI33 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN11AQ9UI33 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN11AQ9UI33 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN11AQ9UI33 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN11AQ9UI33 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN11AQ9UI33 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN11AQ9UI33 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN11AQ9UI33 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN11AQ9UI33 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN11AQ9UI33 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN11AQ9UI33 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN11AQ9UI33 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN11AQ9UI33 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN11AQ9UI33 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN11AQ9UI33 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN11AQ9UI33 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN11AQ9UI33 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN11AQ9UI33 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN11AQ9UI33 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN11AQ9UI33 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN11AQ9UI33 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN11AQ9UI33 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN11AQ9UI33 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN11AQ9UI33 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN11AQ9UI33 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN11AQ9UI33 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN11AQ9UI33 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN11AQ9UI33 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN11AQ9UI33 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN11AQ9UI33 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN11AQ9UI33 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN11AQ9UI33 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN11AQ9UI33 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN11AQ9UI33 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN11AQ9UI33 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN11AQ9UI33 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN11AQ9UI33 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN11AQ9UI33 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN11AQ9UI33 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN11AQ9UI33 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN11AQ9UI33 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN11AQ9UI33 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN11AQ9UI33 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN11AQ9UI33 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN11AQ9UI33 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN11AQ9UI33 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN11AQ9UI33 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN11AQ9UI33 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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