Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC3

ASIC3, Acid-sensing ion channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC3Q9UHC3 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ASIC3Q9UHC3 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ASIC3Q9UHC3 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ASIC3Q9UHC3 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ASIC3Q9UHC3 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ASIC3Q9UHC3 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ASIC3Q9UHC3 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ASIC3Q9UHC3 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ASIC3Q9UHC3 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ASIC3Q9UHC3 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ASIC3Q9UHC3 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ASIC3Q9UHC3 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ASIC3Q9UHC3 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ASIC3Q9UHC3 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ASIC3Q9UHC3 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ASIC3Q9UHC3 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ASIC3Q9UHC3 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ASIC3Q9UHC3 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ASIC3Q9UHC3 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ASIC3Q9UHC3 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ASIC3Q9UHC3 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASIC3Q9UHC3 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASIC3Q9UHC3 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASIC3Q9UHC3 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASIC3Q9UHC3 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASIC3Q9UHC3 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASIC3Q9UHC3 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASIC3Q9UHC3 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASIC3Q9UHC3 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASIC3Q9UHC3 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASIC3Q9UHC3 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ASIC3Q9UHC3 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASIC3Q9UHC3 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASIC3Q9UHC3 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASIC3Q9UHC3 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASIC3Q9UHC3 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASIC3Q9UHC3 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASIC3Q9UHC3 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASIC3Q9UHC3 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASIC3Q9UHC3 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASIC3Q9UHC3 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASIC3Q9UHC3 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASIC3Q9UHC3 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASIC3Q9UHC3 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ASIC3Q9UHC3 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASIC3Q9UHC3 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASIC3Q9UHC3 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASIC3Q9UHC3 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASIC3Q9UHC3 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ASIC3Q9UHC3 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ASIC3Q9UHC3 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASIC3Q9UHC3 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASIC3Q9UHC3 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASIC3Q9UHC3 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASIC3Q9UHC3 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASIC3Q9UHC3 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASIC3Q9UHC3 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASIC3Q9UHC3 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASIC3Q9UHC3 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ASIC3Q9UHC3 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASIC3Q9UHC3 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASIC3Q9UHC3 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASIC3Q9UHC3 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASIC3Q9UHC3 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASIC3Q9UHC3 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASIC3Q9UHC3 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASIC3Q9UHC3 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASIC3Q9UHC3 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASIC3Q9UHC3 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASIC3Q9UHC3 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASIC3Q9UHC3 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASIC3Q9UHC3 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASIC3Q9UHC3 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASIC3Q9UHC3 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASIC3Q9UHC3 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASIC3Q9UHC3 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASIC3Q9UHC3 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASIC3Q9UHC3 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASIC3Q9UHC3 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASIC3Q9UHC3 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASIC3Q9UHC3 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ASIC3Q9UHC3 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASIC3Q9UHC3 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASIC3Q9UHC3 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASIC3Q9UHC3 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASIC3Q9UHC3 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ASIC3Q9UHC3 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASIC3Q9UHC3 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASIC3Q9UHC3 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ASIC3Q9UHC3 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASIC3Q9UHC3 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASIC3Q9UHC3 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASIC3Q9UHC3 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASIC3Q9UHC3 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ASIC3Q9UHC3 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASIC3Q9UHC3 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASIC3Q9UHC3 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASIC3Q9UHC3 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASIC3Q9UHC3 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASIC3Q9UHC3 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms