Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC11.4□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC11.39□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
DKK2Q9UBU2 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms