Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms