Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms