Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG8

KCNK4, Potassium channel subfamily K member 4, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK4Q9NYG8 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNK4Q9NYG8 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNK4Q9NYG8 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNK4Q9NYG8 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNK4Q9NYG8 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNK4Q9NYG8 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNK4Q9NYG8 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNK4Q9NYG8 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNK4Q9NYG8 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNK4Q9NYG8 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNK4Q9NYG8 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNK4Q9NYG8 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNK4Q9NYG8 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNK4Q9NYG8 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNK4Q9NYG8 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNK4Q9NYG8 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNK4Q9NYG8 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNK4Q9NYG8 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
KCNK4Q9NYG8 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms