Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COMMD8Q9NX08 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
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