Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EMILIN3Q9NT22 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
EMILIN3Q9NT22 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EMILIN3Q9NT22 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
EMILIN3Q9NT22 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EMILIN3Q9NT22 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EMILIN3Q9NT22 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
EMILIN3Q9NT22 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EMILIN3Q9NT22 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
EMILIN3Q9NT22 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EMILIN3Q9NT22 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EMILIN3Q9NT22 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
EMILIN3Q9NT22 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
EMILIN3Q9NT22 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EMILIN3Q9NT22 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EMILIN3Q9NT22 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EMILIN3Q9NT22 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EMILIN3Q9NT22 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EMILIN3Q9NT22 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EMILIN3Q9NT22 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EMILIN3Q9NT22 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EMILIN3Q9NT22 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
EMILIN3Q9NT22 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EMILIN3Q9NT22 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EMILIN3Q9NT22 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EMILIN3Q9NT22 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EMILIN3Q9NT22 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EMILIN3Q9NT22 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EMILIN3Q9NT22 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EMILIN3Q9NT22 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EMILIN3Q9NT22 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EMILIN3Q9NT22 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EMILIN3Q9NT22 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EMILIN3Q9NT22 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EMILIN3Q9NT22 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
EMILIN3Q9NT22 AL691447.1-201ENST00000419456 387 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
EMILIN3Q9NT22 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EMILIN3Q9NT22 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EMILIN3Q9NT22 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EMILIN3Q9NT22 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EMILIN3Q9NT22 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EMILIN3Q9NT22 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EMILIN3Q9NT22 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EMILIN3Q9NT22 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EMILIN3Q9NT22 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EMILIN3Q9NT22 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EMILIN3Q9NT22 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EMILIN3Q9NT22 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
EMILIN3Q9NT22 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EMILIN3Q9NT22 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EMILIN3Q9NT22 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EMILIN3Q9NT22 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EMILIN3Q9NT22 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EMILIN3Q9NT22 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EMILIN3Q9NT22 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EMILIN3Q9NT22 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EMILIN3Q9NT22 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EMILIN3Q9NT22 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EMILIN3Q9NT22 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EMILIN3Q9NT22 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EMILIN3Q9NT22 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EMILIN3Q9NT22 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EMILIN3Q9NT22 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EMILIN3Q9NT22 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EMILIN3Q9NT22 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EMILIN3Q9NT22 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EMILIN3Q9NT22 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EMILIN3Q9NT22 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EMILIN3Q9NT22 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EMILIN3Q9NT22 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EMILIN3Q9NT22 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EMILIN3Q9NT22 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EMILIN3Q9NT22 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EMILIN3Q9NT22 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EMILIN3Q9NT22 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EMILIN3Q9NT22 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EMILIN3Q9NT22 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EMILIN3Q9NT22 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EMILIN3Q9NT22 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms