Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE7

ABCC13, Putative ATP-binding cassette sub-family C member 13, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC13Q9NSE7 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ABCC13Q9NSE7 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ABCC13Q9NSE7 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ABCC13Q9NSE7 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ABCC13Q9NSE7 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ABCC13Q9NSE7 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ABCC13Q9NSE7 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ABCC13Q9NSE7 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ABCC13Q9NSE7 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ABCC13Q9NSE7 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ABCC13Q9NSE7 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ABCC13Q9NSE7 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ABCC13Q9NSE7 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ABCC13Q9NSE7 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ABCC13Q9NSE7 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ABCC13Q9NSE7 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ABCC13Q9NSE7 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ABCC13Q9NSE7 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ABCC13Q9NSE7 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ABCC13Q9NSE7 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ABCC13Q9NSE7 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ABCC13Q9NSE7 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ABCC13Q9NSE7 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ABCC13Q9NSE7 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ABCC13Q9NSE7 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ABCC13Q9NSE7 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ABCC13Q9NSE7 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ABCC13Q9NSE7 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ABCC13Q9NSE7 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ABCC13Q9NSE7 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ABCC13Q9NSE7 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ABCC13Q9NSE7 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ABCC13Q9NSE7 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ABCC13Q9NSE7 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ABCC13Q9NSE7 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ABCC13Q9NSE7 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ABCC13Q9NSE7 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ABCC13Q9NSE7 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ABCC13Q9NSE7 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ABCC13Q9NSE7 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ABCC13Q9NSE7 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ABCC13Q9NSE7 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ABCC13Q9NSE7 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ABCC13Q9NSE7 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ABCC13Q9NSE7 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ABCC13Q9NSE7 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ABCC13Q9NSE7 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ABCC13Q9NSE7 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ABCC13Q9NSE7 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ABCC13Q9NSE7 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ABCC13Q9NSE7 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ABCC13Q9NSE7 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ABCC13Q9NSE7 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ABCC13Q9NSE7 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ABCC13Q9NSE7 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ABCC13Q9NSE7 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ABCC13Q9NSE7 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ABCC13Q9NSE7 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ABCC13Q9NSE7 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ABCC13Q9NSE7 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ABCC13Q9NSE7 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ABCC13Q9NSE7 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ABCC13Q9NSE7 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ABCC13Q9NSE7 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ABCC13Q9NSE7 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ABCC13Q9NSE7 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ABCC13Q9NSE7 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ABCC13Q9NSE7 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ABCC13Q9NSE7 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ABCC13Q9NSE7 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ABCC13Q9NSE7 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ABCC13Q9NSE7 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ABCC13Q9NSE7 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ABCC13Q9NSE7 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ABCC13Q9NSE7 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ABCC13Q9NSE7 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ABCC13Q9NSE7 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ABCC13Q9NSE7 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ABCC13Q9NSE7 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ABCC13Q9NSE7 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ABCC13Q9NSE7 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ABCC13Q9NSE7 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ABCC13Q9NSE7 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ABCC13Q9NSE7 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ABCC13Q9NSE7 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ABCC13Q9NSE7 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ABCC13Q9NSE7 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ABCC13Q9NSE7 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ABCC13Q9NSE7 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ABCC13Q9NSE7 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ABCC13Q9NSE7 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ABCC13Q9NSE7 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ABCC13Q9NSE7 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ABCC13Q9NSE7 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ABCC13Q9NSE7 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ABCC13Q9NSE7 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ABCC13Q9NSE7 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ABCC13Q9NSE7 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ABCC13Q9NSE7 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ABCC13Q9NSE7 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms