Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB2

KRT84, Keratin, type II cuticular Hb4, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT84Q9NSB2 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC14.09□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
KRT84Q9NSB2 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
KRT84Q9NSB2 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
KRT84Q9NSB2 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
KRT84Q9NSB2 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
KRT84Q9NSB2 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
KRT84Q9NSB2 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
KRT84Q9NSB2 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
KRT84Q9NSB2 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
KRT84Q9NSB2 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
KRT84Q9NSB2 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
KRT84Q9NSB2 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
KRT84Q9NSB2 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
KRT84Q9NSB2 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
KRT84Q9NSB2 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC14.08□□□□□ -0.16
KRT84Q9NSB2 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
KRT84Q9NSB2 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
KRT84Q9NSB2 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
KRT84Q9NSB2 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
KRT84Q9NSB2 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
KRT84Q9NSB2 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
KRT84Q9NSB2 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
KRT84Q9NSB2 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
KRT84Q9NSB2 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
KRT84Q9NSB2 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
KRT84Q9NSB2 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
KRT84Q9NSB2 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
KRT84Q9NSB2 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
KRT84Q9NSB2 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
KRT84Q9NSB2 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
KRT84Q9NSB2 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
KRT84Q9NSB2 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
KRT84Q9NSB2 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
KRT84Q9NSB2 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
KRT84Q9NSB2 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
KRT84Q9NSB2 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
KRT84Q9NSB2 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
KRT84Q9NSB2 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
KRT84Q9NSB2 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
KRT84Q9NSB2 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
KRT84Q9NSB2 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
KRT84Q9NSB2 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
KRT84Q9NSB2 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
KRT84Q9NSB2 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
KRT84Q9NSB2 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
KRT84Q9NSB2 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC14.07□□□□□ -0.16
KRT84Q9NSB2 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
KRT84Q9NSB2 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
KRT84Q9NSB2 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
KRT84Q9NSB2 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
KRT84Q9NSB2 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms