Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 AC084149.2-201ENST00000438443 797 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms