Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP55

BPIFA1, BPI fold-containing family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA1Q9NP55 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
BPIFA1Q9NP55 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
BPIFA1Q9NP55 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
BPIFA1Q9NP55 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
BPIFA1Q9NP55 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
BPIFA1Q9NP55 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
BPIFA1Q9NP55 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
BPIFA1Q9NP55 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BPIFA1Q9NP55 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BPIFA1Q9NP55 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BPIFA1Q9NP55 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BPIFA1Q9NP55 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
BPIFA1Q9NP55 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BPIFA1Q9NP55 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BPIFA1Q9NP55 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BPIFA1Q9NP55 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BPIFA1Q9NP55 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BPIFA1Q9NP55 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
BPIFA1Q9NP55 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
BPIFA1Q9NP55 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BPIFA1Q9NP55 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BPIFA1Q9NP55 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BPIFA1Q9NP55 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BPIFA1Q9NP55 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BPIFA1Q9NP55 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BPIFA1Q9NP55 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BPIFA1Q9NP55 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BPIFA1Q9NP55 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BPIFA1Q9NP55 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BPIFA1Q9NP55 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BPIFA1Q9NP55 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BPIFA1Q9NP55 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BPIFA1Q9NP55 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
BPIFA1Q9NP55 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BPIFA1Q9NP55 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
BPIFA1Q9NP55 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BPIFA1Q9NP55 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BPIFA1Q9NP55 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BPIFA1Q9NP55 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BPIFA1Q9NP55 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BPIFA1Q9NP55 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BPIFA1Q9NP55 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BPIFA1Q9NP55 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BPIFA1Q9NP55 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
BPIFA1Q9NP55 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BPIFA1Q9NP55 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BPIFA1Q9NP55 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BPIFA1Q9NP55 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BPIFA1Q9NP55 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BPIFA1Q9NP55 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BPIFA1Q9NP55 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BPIFA1Q9NP55 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BPIFA1Q9NP55 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BPIFA1Q9NP55 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BPIFA1Q9NP55 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BPIFA1Q9NP55 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BPIFA1Q9NP55 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BPIFA1Q9NP55 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BPIFA1Q9NP55 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BPIFA1Q9NP55 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BPIFA1Q9NP55 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BPIFA1Q9NP55 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BPIFA1Q9NP55 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BPIFA1Q9NP55 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BPIFA1Q9NP55 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BPIFA1Q9NP55 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BPIFA1Q9NP55 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BPIFA1Q9NP55 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BPIFA1Q9NP55 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BPIFA1Q9NP55 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BPIFA1Q9NP55 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BPIFA1Q9NP55 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BPIFA1Q9NP55 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BPIFA1Q9NP55 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BPIFA1Q9NP55 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BPIFA1Q9NP55 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BPIFA1Q9NP55 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BPIFA1Q9NP55 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BPIFA1Q9NP55 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BPIFA1Q9NP55 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BPIFA1Q9NP55 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BPIFA1Q9NP55 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BPIFA1Q9NP55 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BPIFA1Q9NP55 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BPIFA1Q9NP55 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BPIFA1Q9NP55 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BPIFA1Q9NP55 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BPIFA1Q9NP55 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BPIFA1Q9NP55 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BPIFA1Q9NP55 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BPIFA1Q9NP55 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BPIFA1Q9NP55 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BPIFA1Q9NP55 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BPIFA1Q9NP55 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BPIFA1Q9NP55 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BPIFA1Q9NP55 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BPIFA1Q9NP55 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BPIFA1Q9NP55 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BPIFA1Q9NP55 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BPIFA1Q9NP55 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms