Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms