Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 EPB41L5-205ENST00000452780 6410 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 ANKRD36B-204ENST00000438709 6067 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 NFAT5-209ENST00000567239 6376 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 DLEC1-201ENST00000308059 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 STARD13-202ENST00000336934 5917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM225A-202ENST00000453010 5625 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 MYO1D-202ENST00000394649 5451 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC4A1-201ENST00000262418 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC11.04□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 GOLGA6L4-202ENST00000422563 4155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 PIAS2-201ENST00000324794 4543 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNMA1-210ENST00000404771 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 SPICE1-201ENST00000295872 5417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 CAMTA2-204ENST00000414043 4589 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 KIAA1549-202ENST00000440172 12379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 MAP4K2-201ENST00000294066 7178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.4 ms