Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
KATNB1Q9BVA0 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms