Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms