Protein–RNA interactions for Protein: Q99618

CDCA3, Cell division cycle-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA3Q99618 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms