Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP88Q99567 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms