Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC11□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC11□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC11□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC11□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC11□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC11□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC11□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC11□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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C9orf85Q96MD7 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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C9orf85Q96MD7 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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C9orf85Q96MD7 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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C9orf85Q96MD7 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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C9orf85Q96MD7 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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C9orf85Q96MD7 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
C9orf85Q96MD7 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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