Protein–RNA interactions for Protein: Q96BY7

ATG2B, Autophagy-related protein 2 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG2BQ96BY7 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms