Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP13Q92995 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP13Q92995 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP13Q92995 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP13Q92995 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP13Q92995 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP13Q92995 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP13Q92995 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP13Q92995 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP13Q92995 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP13Q92995 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP13Q92995 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP13Q92995 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP13Q92995 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP13Q92995 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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USP13Q92995 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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USP13Q92995 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP13Q92995 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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USP13Q92995 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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USP13Q92995 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP13Q92995 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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USP13Q92995 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP13Q92995 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP13Q92995 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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USP13Q92995 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP13Q92995 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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USP13Q92995 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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USP13Q92995 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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USP13Q92995 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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USP13Q92995 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP13Q92995 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP13Q92995 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP13Q92995 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP13Q92995 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP13Q92995 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
USP13Q92995 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP13Q92995 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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USP13Q92995 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP13Q92995 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP13Q92995 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP13Q92995 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
USP13Q92995 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP13Q92995 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP13Q92995 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
USP13Q92995 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP13Q92995 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP13Q92995 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP13Q92995 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP13Q92995 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP13Q92995 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP13Q92995 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP13Q92995 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP13Q92995 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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