Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSRNP3Q8WYN3 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSRNP3Q8WYN3 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSRNP3Q8WYN3 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSRNP3Q8WYN3 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSRNP3Q8WYN3 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSRNP3Q8WYN3 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CSRNP3Q8WYN3 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSRNP3Q8WYN3 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSRNP3Q8WYN3 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSRNP3Q8WYN3 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CSRNP3Q8WYN3 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CSRNP3Q8WYN3 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSRNP3Q8WYN3 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSRNP3Q8WYN3 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSRNP3Q8WYN3 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CSRNP3Q8WYN3 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CSRNP3Q8WYN3 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSRNP3Q8WYN3 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSRNP3Q8WYN3 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSRNP3Q8WYN3 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CSRNP3Q8WYN3 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSRNP3Q8WYN3 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSRNP3Q8WYN3 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSRNP3Q8WYN3 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSRNP3Q8WYN3 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSRNP3Q8WYN3 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSRNP3Q8WYN3 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSRNP3Q8WYN3 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSRNP3Q8WYN3 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSRNP3Q8WYN3 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSRNP3Q8WYN3 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSRNP3Q8WYN3 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSRNP3Q8WYN3 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSRNP3Q8WYN3 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSRNP3Q8WYN3 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSRNP3Q8WYN3 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSRNP3Q8WYN3 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSRNP3Q8WYN3 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSRNP3Q8WYN3 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSRNP3Q8WYN3 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSRNP3Q8WYN3 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSRNP3Q8WYN3 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSRNP3Q8WYN3 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSRNP3Q8WYN3 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSRNP3Q8WYN3 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSRNP3Q8WYN3 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSRNP3Q8WYN3 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSRNP3Q8WYN3 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSRNP3Q8WYN3 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSRNP3Q8WYN3 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSRNP3Q8WYN3 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CSRNP3Q8WYN3 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSRNP3Q8WYN3 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSRNP3Q8WYN3 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CSRNP3Q8WYN3 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSRNP3Q8WYN3 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSRNP3Q8WYN3 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSRNP3Q8WYN3 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSRNP3Q8WYN3 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSRNP3Q8WYN3 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSRNP3Q8WYN3 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSRNP3Q8WYN3 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSRNP3Q8WYN3 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CSRNP3Q8WYN3 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CSRNP3Q8WYN3 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSRNP3Q8WYN3 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSRNP3Q8WYN3 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSRNP3Q8WYN3 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSRNP3Q8WYN3 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSRNP3Q8WYN3 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSRNP3Q8WYN3 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSRNP3Q8WYN3 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSRNP3Q8WYN3 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CSRNP3Q8WYN3 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSRNP3Q8WYN3 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSRNP3Q8WYN3 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSRNP3Q8WYN3 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSRNP3Q8WYN3 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSRNP3Q8WYN3 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CSRNP3Q8WYN3 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSRNP3Q8WYN3 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CSRNP3Q8WYN3 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSRNP3Q8WYN3 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSRNP3Q8WYN3 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CSRNP3Q8WYN3 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSRNP3Q8WYN3 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSRNP3Q8WYN3 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSRNP3Q8WYN3 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSRNP3Q8WYN3 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSRNP3Q8WYN3 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSRNP3Q8WYN3 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSRNP3Q8WYN3 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSRNP3Q8WYN3 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSRNP3Q8WYN3 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSRNP3Q8WYN3 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSRNP3Q8WYN3 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSRNP3Q8WYN3 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSRNP3Q8WYN3 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSRNP3Q8WYN3 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms