Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD5

MCOLN3, Mucolipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN3Q8TDD5 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MCOLN3Q8TDD5 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MCOLN3Q8TDD5 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MCOLN3Q8TDD5 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MCOLN3Q8TDD5 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MCOLN3Q8TDD5 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MCOLN3Q8TDD5 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MCOLN3Q8TDD5 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MCOLN3Q8TDD5 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MCOLN3Q8TDD5 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MCOLN3Q8TDD5 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MCOLN3Q8TDD5 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MCOLN3Q8TDD5 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
MCOLN3Q8TDD5 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MCOLN3Q8TDD5 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
MCOLN3Q8TDD5 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MCOLN3Q8TDD5 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MCOLN3Q8TDD5 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
MCOLN3Q8TDD5 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
MCOLN3Q8TDD5 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MCOLN3Q8TDD5 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
MCOLN3Q8TDD5 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
MCOLN3Q8TDD5 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MCOLN3Q8TDD5 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
MCOLN3Q8TDD5 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MCOLN3Q8TDD5 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MCOLN3Q8TDD5 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MCOLN3Q8TDD5 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MCOLN3Q8TDD5 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MCOLN3Q8TDD5 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MCOLN3Q8TDD5 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MCOLN3Q8TDD5 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MCOLN3Q8TDD5 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MCOLN3Q8TDD5 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MCOLN3Q8TDD5 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MCOLN3Q8TDD5 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MCOLN3Q8TDD5 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MCOLN3Q8TDD5 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MCOLN3Q8TDD5 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MCOLN3Q8TDD5 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MCOLN3Q8TDD5 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MCOLN3Q8TDD5 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MCOLN3Q8TDD5 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MCOLN3Q8TDD5 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MCOLN3Q8TDD5 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MCOLN3Q8TDD5 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MCOLN3Q8TDD5 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MCOLN3Q8TDD5 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MCOLN3Q8TDD5 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MCOLN3Q8TDD5 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
MCOLN3Q8TDD5 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MCOLN3Q8TDD5 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MCOLN3Q8TDD5 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MCOLN3Q8TDD5 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MCOLN3Q8TDD5 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MCOLN3Q8TDD5 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MCOLN3Q8TDD5 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MCOLN3Q8TDD5 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MCOLN3Q8TDD5 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MCOLN3Q8TDD5 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MCOLN3Q8TDD5 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MCOLN3Q8TDD5 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MCOLN3Q8TDD5 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MCOLN3Q8TDD5 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MCOLN3Q8TDD5 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MCOLN3Q8TDD5 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MCOLN3Q8TDD5 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MCOLN3Q8TDD5 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MCOLN3Q8TDD5 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MCOLN3Q8TDD5 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MCOLN3Q8TDD5 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MCOLN3Q8TDD5 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MCOLN3Q8TDD5 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MCOLN3Q8TDD5 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MCOLN3Q8TDD5 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MCOLN3Q8TDD5 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MCOLN3Q8TDD5 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MCOLN3Q8TDD5 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MCOLN3Q8TDD5 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MCOLN3Q8TDD5 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MCOLN3Q8TDD5 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MCOLN3Q8TDD5 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MCOLN3Q8TDD5 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MCOLN3Q8TDD5 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MCOLN3Q8TDD5 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MCOLN3Q8TDD5 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MCOLN3Q8TDD5 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MCOLN3Q8TDD5 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MCOLN3Q8TDD5 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MCOLN3Q8TDD5 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
MCOLN3Q8TDD5 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MCOLN3Q8TDD5 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MCOLN3Q8TDD5 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MCOLN3Q8TDD5 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MCOLN3Q8TDD5 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MCOLN3Q8TDD5 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MCOLN3Q8TDD5 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MCOLN3Q8TDD5 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MCOLN3Q8TDD5 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MCOLN3Q8TDD5 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms