Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TMIEQ8NEW7 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
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